Havným poslaním SOS/BirdLife Slovensko je ochrana vtáctva a biotopov. Naše poslanie realizujeme prostredníctvom priamych praktických projektov zameraných na ochranu vtáctva a území, ale aj uplatňovaním a presadzovaním legislatívnych nástrojov ochrany prírody.

Priamu pomoc vtáctvu realizujeme prostredníctvom projektov.

Významným legislatívnym nástrojom je sústava Natura 2000, na ktorej návrhu sa naša spoločnosť spolupodieľala za účasti vedeckých a ornitologických kapacít.